يحمي برنامج المارينا الصحة العامة والبيئة من خلال تثقيف راكبي القوارب بشأن التخلص السليم من مياه الصرف الصحي وتنظيم عمليات القوارب على الشاطئ. مع ازدياد شعبية ركوب القوارب الترفيهية وغيرها من الأنشطة المائية الأخرى، فإن التخلص السليم من مياه الصرف الصحي أمر بالغ الأهمية. يشرف برنامج المراسي على اللوائح التي تتطلب من المراسي والأماكن الأخرى التي ترسو فيها القوارب أن يكون لديها مرافق صحية مناسبة من أجل حماية الصحة العامة وتحسين جودة المياه.
يقوم برنامج المراسي بإصدار شهادة التشغيل (CTO) وإجراء التفتيش السنوي على جميع المراسي والأماكن الأخرى التي ترسو فيها القوارب ومنحدرات القوارب. يتعاون موظفو برنامج مارينا مع الوكالات الحكومية والفيدرالية الأخرى وشركات القطاع الخاص لمعالجة الطلبات ومراجعة الخطط للامتثال التنظيمي. كما يدير برنامج المراسي أيضًا قانون السفن النظيفة ومنح البنية التحتية للقوارب، وكلاهما يساعد المراسي في تعويض تكلفة تركيب أنظمة تجميع مياه الصرف الصحي والبنية التحتية للقوارب.