كيف يعمل التسلسل الجينومي؟
التسلسل الجينومي هو مصطلح يستخدم لوصف مجموعة متنوعة من الإجراءات المختبرية التي توفر معلومات مفصلة عن التركيب الجيني لمسببات الأمراض المعدية (الجراثيم) التي تصيب الناس بالمرض.
يتكون جينوم مسببات الأمراض المسببة للأمراض من الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي. ويتكون كل من الحمض النووي والحمض النووي الريبوزي من "لبنات بناء" تسمى النيوكليوتيدات التي تخبرنا بمعلومات مهمة عن مسببات الأمراض. وتسمى العملية المختبرية لقراءة هذه النيوكليوتيدات باستخدام أدوات المعلوماتية الحيوية بالتسلسل. يخبرنا تحليل جينوم مسببات الأمراض المختلفة بمزيد من المعلومات عن الجراثيم المسببة للأمراض لدى شخص ما أو لدى مجموعة سكانية. وتستخدم إدارة الصحة العامة معلومات الجينوم للعثور على روابط محتملة لانتقال العدوى أثناء التحقيقات في أمراض الصحة العامة ولتحديد المصادر الشائعة للتعرض في التحقيقات المتعلقة بتفشي المرض.
كيف يتم استخدام نتائج التسلسل الجيني؟
- تحليل بيانات الأمراض وتصورها. VDH تحليل بيانات تفشي الأمراض من عدة مصادر. وتشمل معلومات الحالة من أنظمة مراقبة الأمراض لدينا ونتائج الجينوم الممرض. يقوم VDH بإنشاء تصورات للبيانات لنتائج الجينوم الممرض باستخدام أدوات تحليلية مثل Microbetrace, نيكستراين، و ميكرو ريكت. تسمح لنا هذه الأدوات برؤية كيفية انتشار الأمراض من خلال مخططات شبكة الانتقال والخرائط والأشجار الوراثية.
- تفسير التقارير وتوصيل النتائج. يفسر برنامج علم الأوبئة الجينومي التابع لإدارة الصحة العامة في فيلادلفيا النتائج الجينومية ويطور طرقًا لتسهيل فهم هذه المعلومات.
- اتخاذ إجراءات الصحة العامة. يعمل برنامج علم الأوبئة الجينومي عن كثب مع برامج الأمراض المعدية الأخرى في VDH. نحاول معًا منع تفشي الأمراض المعدية في Virginia والسيطرة عليها.